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深入解析“我们所有人”研究计划中的亚大陆遗传变异及其生物医学意义

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Subcontinental Genetic Variation in the All of Us Research Program

探讨“我们所有人”研究计划中的亚大陆遗传变异现象,揭示种族和族群身份与基因多样性之间的复杂关系,分析基因组数据对于精准医学和健康研究的深远影响。

“我们所有人”研究计划(All of Us Research Program)是一项前所未有的生物医学研究项目,旨在通过招募美国超过一百万的参与者,提高少数族裔群体的代表性,加速精准医疗的发展。在这一计划中,研究者通过分析大量全基因组测序数据,揭示了参与者身份标签如自我认定的种族和族裔与他们真实的遗传背景之间存在复杂且多层次的关系。过去,种族和族裔身份多被视为遗传差异的简单代理,但最新研究结果表明,这些社会、文化构建的身份与遗传多样性之间的对应性远不如此简单。 基因变异的分析覆盖了超过23万无亲缘关系的个体,利用超过两百万个常见遗传变异位点的数据,研究团队采用经典的人口遗传学方法以及现代遗传组学工具,对比了全球多个遗传参考数据库。研究发现,参与者在自我认定的种族和族裔分类中,遗传结构表现为沿连续梯度分布,而非明显的界限分明的聚类。这种遗传梯度反映了美国复杂的人口历史轨迹,包括殖民扩张、跨大西洋奴隶贸易和近代的移民浪潮。

具体来说,亚裔、非裔、白人及拉丁裔等美国官方定义的种族和族群身份内部蕴含着丰富的亚大陆遗传多样性。拉丁裔或西班牙裔参与者尤为典型,他们展现出了欧洲、非洲和美洲原住民遗传成分的广泛三重混合,体现出整个美洲大陆及加勒比地区复杂的历史交融。非裔美国人则表现出不同亚非洲群体的遗传贡献,特别是西非和东非不同区域的祖先标记,揭示了奴隶贸易对美国非洲裔基因池的显著影响,同时也体现出地域上的差异性,比如南卡罗来纳州较为集中的西非祖先比例。 随着对遗传数据深入的探索,研究者们不仅关注国家级总体遗传结构,也细致地分析了各州甚至地方的遗传多样性差异。遗传归属与美国各地社会历史和移民模式紧密相连。加利福尼亚、德克萨斯和亚利桑那等西南部州的拉丁裔参与者中,美洲原住民祖先的遗传成分尤其显著,反映了地缘政治变迁和地源性遗传影响。

相比之下,纽约等东北部州拉丁裔人群的非洲祖先成分较高,体现了加勒比地区移民的丰富影响。白人群体内部也存在显著的亚大陆差异,例如北欧血统在中西部更为集中,而南欧血统则遍布南部诸州。 该研究强调传统划分种族和族裔的方式在遗传学研究中存在诸多不足。种族和族裔属于社会文化范畴,无法准确或充分反映个体基因组的多样化结构。研究显示,种族类别之间的遗传差距远小于世界范围内不同人口群体之间的遗传差异,也就是说,仅依靠社会身份无法有效捕获复杂的遗传背景。基于此,科学家们建议在基因关联研究和疾病风险评估中,不应简单使用种族或族裔身份做为调整变量,而应更精确地运用亚大陆层次的遗传祖先成分分析来减少混杂偏差。

研究还揭示了亚大陆森林祖先成份与生物体征之间的显著关联。例如,体重指数(BMI)和身高这两个常见且重要的健康指标,均与不同遗传祖先比例关联密切。在非洲祖先中,西非和东非遗传成分对BMI呈现截然相反的关联,西非祖先比例增高与BMI升高相关,而东非祖先比例则与较低的BMI相关。类似地,欧亚大陆祖先成分与身高的差异性也得到了验证,表明遗传多样性不仅影响疾病风险,也反映在人体形态特征中。 此外,研究考察了基于遗传数据构建的多基因风险评分(PRS)在不同遗传群体中的表现。由于不同祖先群体在等位基因频率和连锁不平衡模式上的差异,单一的欧洲参考组PRC难以准确预测多元族群成员的疾病风险。

研究结果通过综合多族群数据,并引入校正模型,提高了BMI等复杂疾病风险评分的准确性和适用性,推动了精准医疗向更全面、更公平的方向发展。 “我们所有人”研究计划基于大规模、纵向的健康和遗传数据,结合详细的地理与社会经济信息,首次系统地揭示了美国人口遗传结构的亚大陆层次复杂性。这不仅填补了现有全球遗传参考数据库的空白,也为未来生物医学研究特别是涉及多样化基因组数据的疾病关联、遗传流行病学和遗传基础机制研究提供了强有力的基础。 然而,研究也指出,当前对种族、族裔和遗传祖先的使用需谨慎处理。虽然遗传祖先为基因组研究提供了客观且具体的量化指标,社会和文化身份在反映社会环境、文化背景及历史经验方面依旧不可忽视。这种区分有助于更好地描绘健康状况差异中遗传与环境因素的交互作用,推动医学研究在考虑社会决定因素的同时,更加精确地利用遗传信息改善公共健康。

未来,生物医学研究者应重视亚大陆遗传多样性在疾病风险预测、药物基因组学、治疗响应等领域的影响,充分利用大规模项目中所提供的详尽遗传与环境数据,提升诊疗的个性化和公平性。精准医学的实现不仅需要丰富的遗传信息库,更需辩证地融合社会文化因素,真正实现“所有人”的健康福祉。 总之,“我们所有人”研究计划的分析成果深刻揭示了美国人口遗传背景的多层次结构和复杂交错的遗传混合图谱。种族和族群身份虽具有重要的社会意义,但其对于生物医学研究中的基因组祖先代表性来说远远不够。遗传变异沿梯度连续分布,亚大陆层次的祖先成分为科学家提供了更细致和有效的研究工具,促进健康研究向更具包容性、多样性和精准性的未来迈进。

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