古埃及文明作为人类历史上最为辉煌和持续的古代文明之一，其起源与人口构成长期以来一直是考古学、历史学和人类学研究的焦点。近年来，随着古DNA技术的突破，科学家对古代人类遗传结构的认知迈上了新台阶。直到2025年，一项关于来自努维拉特（Nuwayrat）遗址的一位古埃及成年男性的全基因组测序研究，首次揭示了早王朝时期埃及人的基因谱系，开启了全新视角，帮助我们理解早期埃及文明人口的复杂性与多样性。努维拉特个体的遗骸被发掘于位于开罗南部约265公里的努维拉特墓地，该遗骸直接经过放射性碳定年，年龄确定在公元前2855年至公元前2570年之间，正值埃及政治统一后不久，处于早期王朝和旧王国之间的过渡时期。此个体遗体被安葬在一个陶制大罐中，置于岩窟墓内，这种不寻常的葬俗有助于DNA的保存，为古代基因组研究带来了宝贵的样本。通过高通量的测序数据，研究团队构建了该遗骸2倍覆盖的全基因组序列。
遗传分析表明，这位古埃及男性的基因组主要由约78%的北非新石器时代祖先构成，其余约22%的遗传成分源自东部肥沃月湾地区的古代人群，涵盖了美索不达米亚及其周边地带。这种遗传构成与同时期和之后的安纳托利亚及黎凡特地区的新石器时代和青铜时代人群基因特征相似，揭示了埃及与邻近地区早期不仅是文化物资的交流，更存在人群迁徙和基因流动。此前，由于埃及干燥炎热的气候条件限制了DNA的保存，使得对古埃及人群的全基因组研究十分缺乏。早期的尝试多半局限于线粒体DNA或被动目标捕获技术，且样本多来自晚期历史阶段，难以反映旧王国时期及以前的人口状况。努维拉特个体的基因组数据突破性地填补了这一空白，提供了珍贵的基因信息，支持古代埃及人的人口结构兼容了北非与西亚起源的混合成分。除遗传分析外，多学科的考古和生物学方法丰富了对该个体生活环境和身份的理解。
营养同位素分析揭示他在孩童时期生活在尼罗河谷的环境中，以以陆生植物和动物为基础的广泛饮食为主，包括小麦和大麦等谷物，该饮食模式与早期埃及社会的农业发展相符。骨骼病理和牙齿磨损显示他经历了相当年长的生命历程（约44至64岁），并承受了长期的体力劳动，尽管葬俗暗示其社会地位较高。这种矛盾现象为了解早期埃及社会的阶级和职业分工提供了人类学视角。遗传学研究也指导了对该古埃及个体体貌特征的推断，包括棕色眼睛、深色皮肤和棕色头发，这与现代北非及西亚人群特征大致相符。其线粒体DNA分型为I/N1a1b2，Y染色体属于E1b1b1b2b，均常见于当代北非和西亚人群。这一发现强化了该基因组反映的混合遗传背景。
更深入的群体遗传分析利用主成分分析（PCA）和ADMIXTURE聚类展示，该个体在遗传空间中位于现代北非与西亚外群体之间，且没有显示近期近亲通婚的证据。利用qpAdm建模方法，科学家们测试了多种潜在的古代人口来源模型，证实仅有两个主要的邻近来源能够合理解释其基因组成，即摩洛哥中期新石器时代人群和早期新石器时代的美索不达米亚人群，而单一来源模型则被显著拒绝。此外，研究也检视了努维拉特个体基因组中是否存在来自东非如埃塞俄比亚4500年前“莫塔”个体相关的成分结果显示没有明显非洲中部、东部或南部的基因贡献，这与现代部分埃及人群拥有的非洲成分形成鲜明对比，说明这段时期的埃及人口基因结构更倾向于北非与西亚混合，而非撒哈拉以南非洲基因流入。同时，努维拉特遗传成分也被发现作为东非牧民群体西亚相关基因的潜在来源，提示埃及可能是该区域人口基因流的关键节点之一。研究中还对晚期埃及其他古代个体与现代埃及人群进行了比较。第三中间期的埃及人群数据显示与努维拉特个体存在一定连续性，但同时增加了黎凡特青铜时代成分的比例，反映了随着时间推移外来基因的流入与局部人口连续性的复杂交织。
现代埃及人则呈现出更为多样化的混合结构，不仅保留了早期的北非及西亚成分，还融合了晚近阶段来自东非和西非的遗传因素。这项研究的成功也得益于努维拉特个体的特殊葬制——陶罐葬，有助于遗体遗骸的保护及DNA的长期保存。考古学家们认为这种葬俗可能指示该男子具备较高社会地位，进而表明考古发掘和遗传分析结合在揭示古代社会结构和人口史方面的巨大潜力。综合来看，此次全基因组测序揭示了早期王朝埃及人的遗传基础是多元且复杂的，不仅体现了北非新石器时代群体的遗传承袭，也清晰反映了来自东部肥沃月湾地区的基因流动和人口迁徙。遗传学发现与考古证据中的文化交流如农业技术、陶艺制作及文字系统传播相呼应，展现了古代埃及与整个近东地区的深度联系。值得注意的是，古埃及文明的形成并非单一人群的延续，而是多元起源、交流融合及本地演化的连续过程。
未来，随着更多古埃及人遗骸的发现和测序，科学家将能更全面地描绘埃及古人类的遗传多样性和迁徙史，厘清不同历史时期人口动态与社会变迁的关联。同时，这些基因组数据也将有助于考察埃及文明在埃及河谷以外地区以及邻近文明中的人口交流，进一步揭开这片文明摇篮的深厚历史底蕴。通过融合遗传学、考古学和人类学的视角，研究团队正逐步重构那个古老王国时代中人们的生活画卷，为了解人类文明的早期发展提供了前所未有的科学依据和洞见。
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