近期发表在《基因组生物学与演化》上的研究,通过全基因组学分析揭示了Tannerella和Porphyromonas两种与牙周病密切相关细菌的古代物种多样性和生态位适应特征。这一研究不仅为理解口腔微生物的演化历史提供了新视角,也为探索这些细菌在牙周病发展中的作用奠定了基础。研究团队收集了全球范围内的Tannerella(238个基因组)和Porphyromonas(976个基因组)样本,其中包括66个来自古代牙石样本的基因组,这些样本的历史可追溯至14,800年前。通过对这些样本进行全基因组和系统发育分析,研究人员发现了一个新的Tannerella物种,命名为Ca. Tannerella abscondita。这一物种与Tannerella forsythia密切相关,但其毒力谱系存在显著差异。研究还揭示了Tannerella物种和Porphyromonas pasteri在生态位选择上的明显差异,而Porphyromonas gingivalis则没有表现出这种特征。
此外,研究发现病原性基因在不同大陆和口腔生态位中的分布较为均匀,但来自大洋洲的T. forsythia和P. gingivalis唾液菌株以及来自亚洲的T. serpentiformis和P. pasteri菌株则表现出与生态位转变相关的假基因富集现象。通过对P. gingivalis主要纤毛蛋白基因fimA的系统发育分析,研究人员发现这些基因按基因型聚类,且古代基因并未出现在I型和Ib型中。这一研究表明,通过对古代和现代细菌代谢组的新组装,可以更好地代表口腔属在参考数据库中的表现,并增强我们研究这些类群演化历史的能力。这一研究不仅为理解口腔微生物的演化和生态提供了重要依据,也为探索这些细菌在牙周病发展中的作用提供了新的思路。随着古代DNA技术的不断发展,未来的研究有望进一步揭示口腔微生物的演化历史和生态适应机制,为预防和治疗牙周病提供更有效的策略。 。
